1988年8月，中国农工民主党在中国科学技术大学发展了3名党员，同年9月成立农工党中国科大小组，高安丽任小组组长。

1995年3月成立农工党中国科大支部，牛立文任支部主委，高安丽任支部副主委，时有党员7人。
1997年9月至2007年3月先后发展了4名党员，并于2007年4月成立第一届支部委员会，时有党员9人。杨金龙任支部主任委员，王建强任组织委员，沈杰任宣传委员。

2015年6月29日，农工民主党中国科学技术大学支部开换届会议，选举第二届支部委员会，选举董振超为主委，王建强为副主委，陈艳霞为委员。

2021年4月22日下午，农工民主党中国科学技术大学支部换届大会顺利召开。投票选举刘乃安、刘才远、刘海燕、陈艳霞、尉伟为新一届支部委员会；推选刘乃安为主委，尉伟为副主委。

2022年3月22日下午，农工党科大支部召开大会，会议增补陈艳霞同志为支部副主任委员，杨玖重同志为支部委员。

现有党员20人，其中，安徽省政协副主席1人，安徽省人大常委1人，农工党安徽省主委、副主委各1人，教授10人，副教授7人。